胃十二指肠穿孔的典型临床表现就是急性腹痛，也有的急性腹痛不一定是胃十二指肠穿孔，比如胆囊炎有时有右上腹疼痛、阑尾炎有右下腹疼痛。如果是胃十二指肠穿孔则也有疼痛的表现，但是位于上腹部，有时是上腹正中，如胃穿孔。有时是上腹正中偏右点，如十二指肠穿孔。
除了穿孔、腹痛以外，还有发热，这都是炎性腹膜炎的表现。除了症状以外，还有体征，也是临床表现里面的一种。体征就是去做体检有哪些表现，比如上腹压痛。除了压痛以外，有时还有反跳痛，就是手一放一松时疼痛更剧烈，这都是腹膜炎的表现。
因为腹腔不含消化道的内容物，如果胃十二指肠穿孔时消化道的内容物，通过穿孔部位流出到腹腔中，就会引起腹腔炎症，这都是很典型的表现。再加上去做些相关的检查，比如拍腹部立位的X片就可以看到腹腔内有游离气体，基本上就可以确诊胃十二指肠穿孔。早确诊、早去治疗，效果才会好。
