如果明确宝宝拉肚子是乳糖不耐受引起，可以更换奶粉，将配方奶粉换成不含乳糖的配方奶粉，就可以有效缓解症状。如果宝宝吃母乳，可以在宝宝喝母乳的同时给宝宝补充乳糖酶，增加对乳糖的消化能力，也可以有效缓解症状。
随着年龄的增长，宝宝肠道功能逐渐发育，乳糖酶分泌越来越强，可以逐渐将不含乳糖的奶粉换成半乳糖的奶粉，最后再换回普通的配方奶粉。母乳喂养的宝宝可以从加乳糖酶到乳糖酶减量，到最后不加乳糖酶。
也可以用中药的疗法治疗，如果宝宝是乳糖不耐受导致的拉肚子，一般都是脾胃虚弱所导致，可以用健脾的方法缓解，如给宝宝煮白术、山药水，也可以改善宝宝乳糖的耐受能力。
除此以外，可以给宝宝揉肚子、捏脊，揉足三里穴、天枢穴，对于宝宝乳糖酶的分泌功能也有帮助。
