肛瘘术后恢复期新生肉芽里面神经开始生长时会有正常的痒感。但是有的肉芽生长不健康，分泌物比较多，刺激肛门周围的皮肤痒，则并不正常。
换药时主管医生会根据创面的情况判断瘙痒是否正常。如果不正常会根据创面的情况选择外用药物，包括口服药物纠正不健康生长的肉芽。有的人肛门沟比较深，局部透气不好，分泌物积聚在里面，也会刺激皮肤，加重瘙痒。这样的人需要尽量保证局部透气。可以外力辅助将肛门往两侧牵拉，尽量让局部透气。
有的人可能外用药物过敏，也会引起瘙痒，换药时主管医生也会看到局部有皮肤红肿。要停用引起过敏的药物，严重者可以口服抗过敏药物。
