双歧杆菌建议在饭后吃，它作为活菌制剂，主要适用于治疗肠道菌群失调所引起的肠功能紊乱，如急性、慢性腹泻以及便秘等一系列症状。双歧杆菌需要注意在储存过程中避免接触高温，以免导致活菌灭活，此外在用药时也尽量不要用温度过高的水来送服。还要避免和抗菌药物同时服用，因为抗菌药物有可能会杀灭其中的活菌。
此外需要注意对本品过敏者禁用，过敏体质者也应该慎用，在用药过程中还要注意药物的相互作用，如在和抗酸药合用时，可能会减弱其疗效。双歧杆菌作为双歧杆菌的活菌制剂，主要可以和其它厌氧菌共同占据肠黏膜的表面，形成生物屏障，从而阻止病菌的定植和入侵，产生乳酸和醋酸，降低肠道内的pH值，从而抑制致病菌的生长。部分患者在患病后长期口服抗菌药物，可能会引起菌群失调，这种情况下就需要口服来补充活菌制剂。
