排便结束以后肛门出现疼痛，有以下几种原因：

1、肛裂：肛裂是常见的肛肠疾病，临床特征是排便时肛门出现疼痛，排便结束后疼痛缓解1-2分钟，并且会再一次出现更加强烈的疼痛。便后的这次疼痛因人而异，有的人持续时间较短，可能只有几分钟。而有的人持续时间比较长，可能持续1天的时间；

2、痔疮：痔疮出现疼痛，一般排便时对痔体的刺激会造成不舒服、疼痛的感觉，但是便后疼痛即可缓解；

3、肛门痉挛综合征：可能排便刺激以后，引起便后肛门痉挛性的疼痛。

对于这种长期、慢性的盆底痛，目前而言并不能明确具体疾病，只能通过综合的治疗缓解疼痛。