一般情况下，小的腘窝囊肿不需要做手术，而比较大的腘窝囊肿，压迫了神经、血管引起了症状，才需要手术治疗，手术通常情况下，大约需要一小时就可以完成。

腘窝囊肿是长在膝关节后方腘窝的囊性的包块，属于良性的病变，主要是因为关节腔里面的润滑剂、关节液，只能进入囊袋，而不能出来，慢慢地就会造成囊袋、囊肿的逐渐增大，从而形成囊肿样的结构。很多时候是因为膝关节疼痛，体检意外发现。小的腘窝囊肿，如蚕豆大小、鹌鹑蛋大小，甚至于鸡蛋大小的腘窝囊肿，一般都不引起症状，可能在外观上站立时，可以看到后方有囊性的包块，按压比较软、没有疼痛，这种情况下一般不需要做处理。

但如果囊肿非常大，刺激和压迫了后方的神经以及血管，引起的小腿后侧的酸、胀、麻，没有办法正常地下蹲，此时就可以采用手术治疗。手术分为微创手术和开放手术，微创手术通常情况下手术时间相对比较长，有一定的复发概率。而开放手术手术时间更短，大约需要一个小时，手术以后尽量地将活瓣结构，以及囊壁彻底地切除，这样就可以减少复发的概率。