肾囊肿一般不会疼，除非发生了其它并发症的情况，肾囊肿有良性的肾囊肿和恶性的肾囊肿。

1、良性肾囊肿：其在体积较小时，不会发生任何有感觉的情况，如果体积较大，有可能出现胀疼，或者此种囊肿伴有感染或者出血、破裂的情况下，就会出现疼痛，乃至剧烈的疼痛，需要紧急的泌尿外科处理；

2、恶性肾囊肿：如果恶性肾囊肿在小的时候，可能也没有任何感觉，当出现大囊肿时，有可能发生破裂、出血、感染以及伴有肿瘤的其它异常，这种肾脏囊肿也可以出现疼痛。当然这种囊肿，需要做泌尿外科相应的手术处理。

排除了以上情况，多囊肾造成的囊肿在早期也没有任何症状，只是在体检时发现或根据家族史来进行判断。当这种囊肿逐步增大到直径十几公分时，可以出现腰部胀痛或者肾脏囊肿的胀痛。

当这种囊肿出现破裂、出血、感染的情况，也可以出现剧烈的疼痛，这种疼痛是由于囊肿增大破裂而出现。所以这种情况下需要肾脏内科和泌尿外科来共同完成，因为多囊肾造成了肾脏增大而出现的疼痛，有可能伴有高血压或者血中肌酐的升高，这些都会影响到治疗的效果。