支原体感染后咳嗽可能是由于呼吸道炎症刺激，导致呼吸道上皮细胞损伤，造成气道高反应性咳嗽的敏感性增加，支原体感染引起的咳嗽特点多为阵发性的干咳，少数患儿会出现黏痰，痰中偶尔带有血丝；随着病程进展，咳嗽逐渐加重，个别患儿可能会出现类似百日咳的痉咳，甚至连声咔咳。
百日咳感染后咳嗽需祛除病因，足疗程应用大环内酯类抗生素来进行抗感染治疗，同时可应用易坦静、愈美颗粒等药物进行止咳化痰的对症治疗，但不建议患儿应用中枢性的镇咳药，还可以用酮替芬或孟鲁司特来降低咳嗽的敏感性、改善气道的高反应性，对严重的、顽固性的感染后咳嗽的患者，在一般治疗无效的情况下，可以短期使用吸入糖皮质激素以降低咳嗽的敏感性，改善气道的高反应性；此外，感染后的咳嗽也具有一定的自限性，病程一般可持续2-8周。
