临床上膀胱灌注以后，根据不同的药物反应程度也不一样。临床上最常见的一系列反应，包括灌药以后出现尿频、尿急、尿痛，排尿时下腹部刺痛、灼热等不适为典型症状。
其发生原理是由于灌输到膀胱内的药物，部分具有化学刺激性，可以刺激膀胱黏膜出现水肿、出现炎症反应。可以导致膀胱敏感性增高，出现尿频、尿急，刺激尿道有时甚至会出现排尿困难、尿痛等症状。
现在随着临床药物的不断改善，有对膀胱刺激性比较小的药物。临床上比较常见的生物免毒或者减毒的生物活菌，通过灌注以后可以引起局部免疫反应来发挥抗肿瘤的作用。
相对于临床上比较常见的，以前用的丝裂霉素、吡柔比星、表柔比星。上述这些化学毒性药物刺激性要小。
