益生菌调理胃肠，使用时间因人而异、因病而异，没有具体的时间。对于长期用抗生素的患者，服用益生菌调节肠道菌群，通常为0.5个月，对于长期的便秘患者，则可以长期使用益生菌。

在益生菌的选择上，在不同的情况下选择也不尽相同。长期便秘的患者，可以使用乳酸菌和双歧杆菌，对便秘有一定帮助，反复腹泻患者，使用枯草芽孢杆菌与双歧杆菌较好。益生菌的选择应该在医生指导下进行，对于有腹泻、便秘等疾病的患者，需要明确便秘或腹泻的原因，排除器质性病变以后，可以进行益生菌调理，调节肠道微生态，达到保护肠道健康的目的。