阴茎肿痛的原因比较多，常见如下：

1、包皮嵌顿：有些患者包皮过紧，甚至是包茎状态，在洗澡或者在自慰的时候，强行翻包皮，最后导致包皮口被嵌顿在龟头冠状沟部位，这种情况下包皮难以复原，基本上一个小时左右的时间，包皮就可以发生严重的静脉回流障碍，发生严重的水肿和疼痛，所以病人往往会急诊就诊；

2、感染：阴茎的肿痛和皮下的蜂窝组织源，感染性病变有关系，部分患者是由于剃胡刀剃阴毛的时候，或者阴茎的皮肤上，有小的感染性疖子，随意挤、捏，最后导致局部感染扩散，形成阴茎皮下的蜂窝组织炎、皮下筋膜炎，表现是大范围肿胀疼痛；

3、物理因素：比较极端的个别病人，因为一些特殊自慰的方式，最后使自己的阴茎嵌顿在，某个特殊的工具器械里，最后导致阴茎肿胀疼痛。比如卡在啤酒瓶里，或者卡在锅盖里，在临床上并不少见。

所以一旦出现肿痛的问题，及时到医院来就诊，必要时，需要接受专科的药物治疗，甚至手术治疗。