小孩长期便秘时，首先需要确定其是否存在结构性异常。便秘的原因可以分为结构性异常导致的便秘和功能性便秘。其中结构性异常如结肠梗阻等，可能需要除常规治疗方法外，进一步的外科介入，如切除部分肠管，以达到根本性治疗。
手术治疗需要医生的严格评估，因为手术风险较高，并不是所有患有此类异常的小孩都适合手术。与此不同，有的小孩可能只是功能性便秘。
针对功能性便秘，首先要调整饮食结构。例如确保小孩摄入足够的食物，特别是油脂和高膳食纤维的食物，同时增加水分摄入，这些基础的饮食调整有助于缓解便秘。
其次，可以考虑为小孩补充益生元益生菌或使用如乳果糖、聚乙二醇等药物来缓解便秘。开塞露可在小孩急性便秘时短期使用，但由于可能引起局部损伤或依赖性，长期反复使用应当避免。
最后，也需引导小孩培养良好的排便习惯，如设定固定的排便时间，例如每天早晚坐盆，以助于长期缓解便秘。
