咽炎及会厌囊肿均可引起咽部异物感，但引起的异物感不同。咽炎所引起的咽部异物感无明显部位且部位并不固定，患者可能只想清嗓子且伴有黏痰。而会厌囊肿所引起的咽部异物感存在大致位置，且位置较固定。所以是否存在明显固定位置的咽部异物感，则是咽炎与会厌囊肿的主要区别。
咽炎通常为临近部位的炎症蔓延到咽部所引起，如鼻炎、过敏性鼻炎、鼻窦炎、扁桃体炎、牙龈炎以及胃食管反流、气管炎、支气管炎等，均可导致咽炎，治疗咽炎时需要从病因入手。而会厌囊肿通常是由于黏膜囊肿或潴留囊肿导致，若患者的异物感较明显，则可以进行手术切除。
