羊水过多可能会提示胎儿有一定程度的结构发育异常，当出现羊水增多时，大概有5%胎儿会有觉明显的结构方面的畸形。
因为羊水的产生大部分来自于胎儿的小便，胎儿在宫内时羊水产生是一个动态平衡，羊水即胎儿小便，尿出来然后再由胎儿吞下去。如果在这个过程当中胎儿只能尿出来但却吞不下去，比如有消化道梗阻，即消化道发育异常，羊水则会增多。所以在羊水过多时先要怀疑胎儿发育是否异常，最常见的就是消化道梗阻。
此外，还要考虑胎儿中枢神经系统发育异常。最常见的是无脑儿、脑脊膜膨出，这种胎儿由于裸露的脑脊膜会渗透出大量液体，所以也会导致羊水偏多。所以出现羊水过多时需要进行详细的B超畸形筛查，以排除胎儿各方面的结构异常。
