肝囊肿术后一般复发的概率极低，具体与肝囊肿的数量有关，以下两种情况可出现类似复发的表现：
1、肝实质内小囊肿未处理：一般如果手术，仅会对较大的囊肿进行相应处理，而较小、位于肝实质内的囊肿通常在术中并没有办法处理。这种情况下一些小的囊肿就有可能增大，并逐步形成比较大的囊肿，有可能需要再次的治疗，所以这种情况也不叫复发；
2、囊腔较大：当肝囊肿比较大的情况下，做开窗手术以后，这类的开窗手术通常导致的囊腔比较大。在外界因素的影响下，如位于膈肌下的囊肿，位于其他的一些有网膜包裹位置的囊肿，此时可能囊腔过大，术后直接由于膈肌或者网膜粘连等因素重新形成囊性病变。此情况下通常感觉上去像是复发的病灶，因为囊腔较大的情况下，很难快速的收缩，而囊壁被封盖以后就很容易再次形成一个在检查上类似囊肿的结构。所以此情况下需要注意，特别是针对右侧膈下的大囊肿，更容易导致这类的情况发生，即类似于复发的情况。
