甲胎蛋白阴性通常指的是甲胎蛋白的表达水平不高的意思。甲胎蛋白是临床上经常会检测到的一种肿瘤标志物，属于一种胚胎类的抗原，升高可以发生在恶性肿瘤，也可以发生在良性疾病，具体如下：

1、恶性肿瘤：如原发性肝癌、生殖腺来源的恶性肿瘤，都可以出现甲胎蛋白明显增高的情况。在检测甲胎蛋白的时候，如果出现了甲胎蛋白阳性或者甲胎蛋白的定量，数值高于正常值的范围，就要建议病人做肝脏的相关检查，包括肝脏的增强CT、增强核磁共振检查，做肝炎病毒的检查等，去明确是不是有可疑的病变存在。另外还应该检查睾丸和女性的妇科，观察这些部位有没有可疑的占位，最终要通过病理学检查来确诊；

2、良性疾病：比如肝硬化、肝炎等，同样可以出现甲胎蛋白增高的情况，要注意鉴别。临床上为了更好的区分甲胎蛋白的增高情况，一般并不会采用阴性或阳性来代表甲胎蛋白的表达情况。而通常会通过定量检测方式来确定甲胎蛋白增高的数值。