风湿性心包炎的性质其实与风湿性心脏病、关节炎、心脏瓣膜病的发病机制相似。起始原因可能是细菌感染，但后来对心脏、肾脏、关节、瓣膜、心包造成损害的炎症，已经不是病原体的直接作用。
实际上导致损害的炎症是非感染性炎症，现在认为机制是原始病原体与心肌细胞、心包、肾脏等某些组织可能有相同抗原。机体的免疫系统在消灭病原体同时，会把自身具有相同抗原的组织误认为是病原体，所以会产生免疫反应。免疫反应导致心包、瓣膜、心肌、关节等出现炎症改变。
这种炎症改变其实并不是直接的细菌或者病毒所导致，是一种非感染性炎症反应，自身的免疫或者炎症反应体现在局部，会出现损伤改变。
