若为偶尔一次发炎，药物治疗即可，若为长期反复发炎，建议手术治疗。
扁桃体化脓一般考虑为急性细菌感染性炎症，此时一般选取抗生素治疗，但是建议大家在选取抗生素之前，一定要查血常规，因为有些患者是由于上呼吸道病毒感染合并细菌感染，所以可能需要双管齐下，再用抗病毒和抗炎药的基础上，传统中药治疗扁桃体化脓效果也较好。
但若出现扁桃体周围炎或者扁桃体周围脓肿，可能要去耳鼻喉科就诊，甚至需要急诊手术把脓液放出来，否则影响呼吸，危及生命。
若扁桃体经常化脓，单年发作，1年超过几次，或者连续2年发作，每年超过5次，或者连续3年发作，每年超过3次，只有1次化脓性扁桃体炎或者扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿的发作，建议进行扁桃体的手术切除，此时不太考虑扁桃体大小，只与发炎的次数有关。
若患者抗O明显增高，出现风湿性心脏病，不明原因的血尿、蛋白尿、风湿性关节炎，和一些免疫系统疾病，也考虑扁桃体切除。
