头疼一般医学上指头痛，高原反应本质是一种脑部缺血、缺氧反应，患者可以表现为头痛。发生高原反应时，身体氧气携带比较少，因此进入头部的氧气比较少，而心脏需要快速搏动，才能使较多血液进入脑部，以此供应氧气。脑部在血液供应足够的情况下，可以随血压升高、心跳加速，出现血管异常的痉挛动作，从而出现高灌注性头痛，如果供氧充足，大脑不会形成缺氧改变。
如果供氧不足，导致大脑缺氧，可以导致脑水肿等改变，脑水肿可以加剧头痛，出现高颅压问题，即脑水肿，引起脑组织体积增大，由于大脑范围有限，因此大脑没有肿胀空间，从而导致患者出现头痛加剧的表现，头痛加剧最终导致患者出现恶心、呕吐、发热、昏迷等高原反应。明确病因以后，患者需要尽快进行吸氧治疗，促使脑部恢复正常状态，减少高原反应引起的头痛和发热。
