支原体、衣原体感染之后，存在自愈的可能性，但是由于感染类型不同，可能需要采取相关治疗措施。衣原体常会导致宫颈炎或盆腔炎，甚至有可能影响生育，因此出现衣原体感染时建议积极治疗，不要等待自愈。

支原体为条件致病菌，检测到以后是否需要治疗，需根据具体类型判断。若为生殖支原体感染，通常建议治疗。若为解脲支原体感染，同时合并支原体感染的症状，也需要治疗。解脲支原体感染但无症状时是否需要治疗，目前存在争议。而对于人型支原体或牛型支原体感染，通常无症状，无需治疗。