支原体感染不会影响怀孕，而衣原体感染有时会影响怀孕。正常情况下女性宫颈黏膜有支原体存在，所以支原体感染有时并不是病理情况，也不需要治疗。衣原体感染不同，正常女性机体不存在衣原体，如果检查出衣原体就属于病理情况，这时要给予治疗。衣原体会感染输卵管黏膜，从而会破坏输卵管黏膜组织，所以对生育力有较大影响。