引起患者在深呼吸时肺部有疼痛感的原因有很多，比较常见的有以下几种：第一、可能是由于胸膜牵拉原因导致；第二、可能是由于炎症或者胸椎退变、胸椎结核、胸椎损伤等所引起，呈刺痛或烧灼样痛，咳嗽、深呼吸或打喷嚏时疼痛最为剧烈；第三、可能是呼吸道感染和支气管炎引起的胸痛。如果在深呼吸时有疼痛感发生，建议及时去正规医院检查身体，必要时拍胸片查明病因。如果是炎症可以使用阿奇霉素和头孢治疗，如果是其它原因根据医嘱来进行规范治疗。