牙龈下长了个肉疙瘩有可能是形成了瘘孔，有可能是慢性根尖周炎的瘘孔，也可能是牙周炎的瘘孔。在形成慢性根尖周炎时，相应的牙根的根尖部就可以形成肉疙瘩，称为瘘孔，中间有窦道和根尖相连。
如果根尖周围的炎症急性发作，形成了脓汁，脓汁就可以从根尖周围通过窦道，再通过瘘孔流入到口腔，所以它是根尖周炎分泌物引流的出口。如果有牙周炎，也有可能形成瘘孔，最常见的是在磨牙的根分叉局部，如果有根分叉病变，而且有一些炎症的肉芽组织，往往在其相应的牙龈部有一个肉疙瘩，通过肉疙瘩探查，可以达到根分叉区。