第二代头孢菌素主要是包括口服的头孢克罗、头孢丙烯、头孢呋辛酯，还有一些静脉注射的，比如头孢呋辛、头孢孟多等等。第二代头孢菌素对革兰氏阳性球菌的作用仍然比较强，对革兰氏阴性杆菌的活性有所增强，但是仍然比较弱，同时它对厌氧菌的作用还是不错的。但是对铜绿假单胞，就是绿脓杆菌仍然是无效的。
因为第二代头孢菌素有非常多的口服制剂，而口服的头孢菌素往往吸收效果比较差，它能达到的血药浓度相对静脉给药的二代头孢比较低，所以第二代头孢菌素主要适用于一些轻症的感染。同时像头孢呋辛还可以用于外科手术切口的预防感染，也就是说为了防止外科手术切口出现感染，可以在手术前或者麻醉前30分钟，给予头孢呋辛来预防。