宝宝牙齿有黑点的原因，具体如下：
一、宝宝服用中药制剂或喝颜色深的饮料时，大量外源性色素会沉积在牙齿表面，形成黑色斑点或斑片。
二、喜欢吃甜食的宝宝，如果不注意口腔卫生清洁，大量食物残渣和软垢可在牙齿表面形成酸性代谢物质，造成牙釉质脱矿，产生龋损，牙齿釉质层可出现褐色斑片或产生龋洞，X片显示黑色区域的密度明显降低。
三、患有氟斑牙或四环素牙时，牙齿受到药物的影响，在釉质层出现黄褐色或黑褐色的斑片，严重时会造成实质性缺损。