甲状腺手术后容易出现并发症，最危急的并发症就是甲状腺危象。大部分都是由于手术前准备不充分造成，患者受到手术不良刺激之后，会有大量甲状腺激素分泌到血液之中，从而使患者出现心跳加快、高热、瞻望、昏迷、休克等症状，严重者会导致死亡。患者必须要立即进行抢救和治疗，使用抗甲状腺激素药物和糖皮质激素进行治疗，有些也可以使用复方碘溶液进行治疗。
甲状腺手术后还容易出现切口出血，也比较危急。当出血比较多的时候，会压迫气管和食管，造成呼吸困难和吞咽困难等症状，必须立即进行检查和处理，要把切口内的出血清理掉，并且要再次进行止血，把出血的血管结扎好。