患者体温36℃仍然有头疼的症状，可以排除感染性疾病导致的头痛，比如感冒、发热，或者中枢神经系统感染。
引起头痛的因素比较多，要根据患者头痛发作的形式、相关检查来判断，如果患者是两侧的颞部或者一侧颞部呈现搏动样的疼痛，反复的发作，要考虑是偏头痛，偏头痛在临床上是非常常见的，可能因为休息不好、劳累、精神紧张等容易诱发。
患者头疼也有可能与神经因素有关，比如因为工作压力大造成患者紧张性头痛的发作。患者体温36℃，头疼也有可能是五官科疾病导致的，比如鼻窦炎、青光眼，都会导致患者有头痛的症状。