水样的精子可能会导致不孕，因为正常的精液一般是抽后的胶冻样，在蛋白水解酶的作用下，15分钟后精液便从凝固态转变成液体状态。精液的凝固蛋白是由精囊腺分泌的，而液化因子是由前列腺分泌的。
如果水样的精子在射入阴道后容易流出，容易导致不育。在精液分析的时候，精液如果呈现水样，可能和精囊的疾病有关系。如果射出的精液量少，且成为水样，则考虑有射精管梗阻，或者由于先天性的精囊腺和射精管缺陷所导致。
因此如果出现水样精子，建议去正规医院行相关的精液分析，明确是否存在这方面的因素，作出正确的处理。