女性的月经经期在2-8之内都是正常的，所以单纯从时间的角度讲，月经三天干净是在正常的范围之内，不会影响到女性的排卵。
但是如果女性月经三天干净，同时有月经周期紊乱、月经量异常，这种情况下考虑患者可能有内分泌紊乱的情况。如果存在内分泌紊乱，就会影响到女性的排卵。
比如当女性卵巢功能下降时，女性的月经周期会延长，月经量会减少，月经经期可以在三天之内干净，这种情况下女性的雌激素水平低，女性卵泡生长发育过程会相对延长。
即使卵泡能够发育成熟，黄体生成素没有出现高峰值，女性也不会出现正常的排卵而形成囊肿，会影响到女性的受孕。