急性肾小管损伤大部分可以恢复，但是对于慢性的肾小管损伤，恢复起来就比较难。急性肾小管损伤损伤比较轻的时候，仅仅是肾小管上皮细胞的损伤，如果损伤比较重，肾小管上皮细胞会出现坏死，病人可能会出现急性肾损伤的表现，甚至会出现血肌酐的升高，以及尿量减少、无尿的情况，通常会给病人做血液透析治疗，同时针对损伤的原因对因治疗，大部分病人的肾小管损伤可以恢复。
对于慢性肾小管损伤，往往是因为长期的应用中药、保健品、草药、土方等，缓慢损伤病人的肾小管上皮细胞，同时对肾小管间质也有损伤，所以肾小管损伤以后恢复起来比较难。