有些疾病的表现为是半夜咳嗽，相对最常见的可能是支气管哮喘，现在的气管哮喘多数表现上有咳嗽病因性哮喘，也就是季节性干咳为主要表现，伴有痒感，为阵发性，如果控制不太好，夜间会比较重，这时候一般是迷走神经张力比较高，所以有过敏体质又有半夜咳嗽情况，要到医院做肺功能检测，除外哮喘。
还有疾病是心源性，心力衰竭患者在夜间平卧的时候回心血量增多，这时会出现咳嗽，有的时候可以有粉红色泡沫痰。如果是平素下肢反复水肿，容易出现端坐呼吸，不容易平卧，要考虑这方面的情况。常见可能是反流性食道炎，胃酸反流到咽腔的时候，可能有刺激性的咳嗽比较剧烈。还有药物特别是降压药会导致缓激肽的蓄积，引起半夜的咳嗽。