扁桃体炎分为急性和慢性，引起急性扁桃体炎的病原体一般是链球菌和葡萄球菌。
针对这样的细菌最好选择青霉素或者头孢菌素抗生素治疗，如果过敏可以选择红霉素，阿奇霉素或者氨基糖甙类抗生素，但是儿童患者及肾功能障碍的患者不建议用氨基糖甙类抗生素。
药物应用要规范，并且足量、足疗程，否则扁桃体炎容易反复发作，青霉素和头孢菌素是时间依懒性型抗生素，每天分2-3次应用，否则达不到杀菌的有效血药浓度。
如果伴有发热，可以用清热解毒类的中成药，体温超过38.5℃，可以用退热药。血常规检查提示合并病毒感染，可以合用抗病毒药物，并且休息注意和饮食。