脑部核磁共振能够诊断出很多的脑部疾病，比如可以对脑部占位性病变进行检查，判断占位性病变是胶质瘤、脑膜瘤、转移瘤，还是其他肿瘤，也可以对患者的脑血管进行检查，判断患者是否有脑梗塞或者脑血管畸形等问题。
此外，核磁共振还能够检查出患者是否有脑部的炎症、脓肿，是否有寄生虫病或者脑白质病等。总之，核磁共振能够检查出的疾病种类比较多，而且磁共振对人体没有辐射作用，所以比较广泛的用于头部影像学检查，特别是脑梗塞或者脑肿瘤的患者，应用的非常多。