先天性巨结肠是比较严重的疾病，由于先天性巨结肠，肠细胞内的神经节生长发育不完善，往往导致结肠扩张，甚至出现顽固性便秘、不全性肠梗阻。严重的患者有可能在日常生活中，如果饮食过量或者是排便困难，有导致肠穿孔的可能性。因此，对于先天性巨结肠，一定要引起高度的重视。
临床当中对于诊断明确的先天性巨结肠，最好是采取外科手术的方式，切除病变或者是多余的结肠，进行肠管重新的吻合，这样可能有效缩短结肠，减少便秘，以及不全性梗阻术后的症状。总之，先天性巨结肠的患者，一定要到正规的结直肠外科或者普外科就诊，根据病情选取合适的治疗方案。