小便刺痛流脓，则考虑患有化脓性的尿道感染，也可能因为不洁的性接触而导致患有淋病，或者非淋球菌性尿道炎等性传播疾病，需要到医院进一步留取脓液作涂片和培养检查来确诊。
如果近3个月之内有过不洁的性接触史，则高度怀疑患有淋病，这时脓液涂片检查可见革兰氏阴性双球菌，需要进行积极的治疗，否则可能会出现尿道狭窄。
如果培养出金黄色葡萄球菌，则多为表皮细菌感染所致，患者除外刺痛、流脓，还可能出现全身感染的症状，需要积极的抗感染治疗。如果培养出支原体、衣原体，则考虑非淋球菌性尿道炎，其也是一种性传播疾病，需要伴侣双方进行同时治疗。