头孢氨苄甲氧苄啶胶囊属于抗生素，适用于耐青霉素的葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌、大肠杆菌等细菌感染。头孢氨苄甲氧苄啶胶囊由头孢氨苄和甲氧苄啶组成，头孢氨苄属于第一代头孢菌素，除肠球菌属、甲氧西林耐药葡萄球菌外，肺炎链球菌、溶血性链球菌，以及产或不产青霉素酶葡萄球菌的大部分菌株均对此药敏感。
此药对奈瑟菌属有较好的抗菌作用，对部分大肠埃希菌、奇异变形杆菌、沙门菌和志贺菌也有一定抗菌作用，厌氧革兰氏阴性菌对此药中度敏感。甲氧苄啶属于抑菌药，可以干扰细菌的叶酸代谢，两药合用可以增强抗菌作用。