患者一只眼睛突然很痛、充血的处理，主要取决于其致病原因，并予以对症治疗，具体如下：
1、细菌感染：细菌感染导致的细菌性结膜炎、角膜炎而引起的眼睛疼痛、充血，需要选择抗细菌的眼药水、眼膏，常用药物包括左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、氧氟沙星眼膏等。
2、病毒感染：病毒感染导致结膜炎、角膜炎而引起的眼睛疼痛、充血，需要选择抗病毒的眼药水以及眼膏，例如干扰素眼药水、更昔洛韦眼膏等。
3、真菌感染：真菌性角膜炎引起的眼睛疼痛、充血，需要点抗真菌的眼药水，常用的药物包括那特霉素滴眼液等。
4、葡萄膜炎：葡萄膜炎引起的眼痛、充血，需要使用抗炎眼药水以及散瞳药物等。
5、青光眼：患者眼睛突然疼痛、充血，需要使用降眼压的药物。