硼酸洗液洗龟头常用于包皮龟头炎的治疗，对包皮龟头无明显伤害，只是需要注意硼酸水的浓度和适应症。包皮龟头炎的病原体包括白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体和相关的细菌感染。
治疗的基本原则就是消炎、杀菌和内外兼治，一般对于细菌性的包皮龟头炎选用抗生素口服和外用的清洗溶液，其中就包括硼酸水。用于细菌感染的包皮龟头炎的硼酸水浓度为3%，也可以选择0.1%的雷夫诺尔溶液清洗局部，每日两次，每次20分钟。
对于其他类型的如滴虫性包皮龟头炎和念珠菌性包皮龟头炎，建议使用其他类型的外用清洗溶液。因此硼酸洗液洗龟头，要考虑具体病原微生物的情况。