植物神经功能紊乱是在一些社会和心理因素的共同影响下，产生的一系列生理和心理的反应。植物神经功能紊乱的出现与外界环境有关，也与自身的性格有关。治疗的方法就是综合性的治疗，首先要去除诱发因素，比如外界不良因素的刺激，紧张、思虑过度、过度疲劳等等。同时，养成良好的生活规律，良好的生活习惯有助于身体健康，而且也有助于培养良好的一种心态。
在遇到不良刺激的时候，要及时进行心理疏导，培养乐观、豁达的性格，增强自身的抗压能力，保持良好的情绪。症状比较轻的时候，经过一般的心理疏导和行为疗法，一般可以得到改善，或者可以辅助比较温和的药物，比如谷维素、维生素B1。如果症状比较严重，也可以服用其他抗抑郁的药物或者抗焦虑的药物治疗。常用的有5-羟色胺再摄取抑制剂之类的药物，都有很好的疗效，比如西酞普兰、盐酸舍曲林、盐酸文拉法星、盐酸度洛西汀等等。植物神经功能紊乱的病人常常有睡眠不好，可以临时加助眠的药物，这些药物都需要在医生的指导下合理使用。