宝宝拉肚子时可以适当吃益生菌，益生菌能够调节肠道菌群，改善肠道功能，促进肠道内营养物质的消化、吸收。
益生菌可以双向调节，腹泻、便秘都可以应用。对乳糖不耐受引起的腹泻，益生菌可以改善肠道功能，促进肠道功能的恢复，促进乳糖酶的分泌增加，也可以提高机体的免疫力。益生菌可以抑制肠道炎症，保护肠道黏膜的屏障功能。对于感染性的腹泻，益生菌可以抑制肠道的炎症，这种正常的肠道菌群可以抑制异常的致病菌繁殖。因此腹泻的宝宝可以适量服用益生菌，但是疗程不宜过长，一般的1-2周就可以，症状消失之后要及时的停用益生病。
不建议宝宝长期服用益生菌，因为人体有自己的益生菌系统，长期的服用益生菌容易影响自己菌群平衡的建立。