男童小便痛常见于两方面的原因：
第一、观察孩子的阴茎部位是否有红肿，如果阴茎部位有明显的红肿，要考虑存在有阴茎、包皮的炎症，孩子排尿的时候就会出现疼痛、不舒服。
第二、如果包皮阴茎部位没有明显的红肿，就要考虑孩子可能存在有急性的泌尿系统的感染。这时需要将孩子的尿液收集起来，送到医院进行化验，同时做尿培养和泌尿系的超声。如果确定是急性的泌尿系统的感染，就需要选择敏感的抗生素，一般建议选择青霉素类、头孢类的抗生素。同时建议让孩子多喝水，尽量不要长时间憋尿，以改善临床症状。