造成儿童发烧后耳朵疼的原因，是由于感染了急性中耳炎造成的。如果儿童患有急性的上呼吸道感染，尤其口腔中或者鼻子中有炎症，会引起炎症的局部扩散，这种情况很容易造成儿童的中耳炎。
中耳炎发生以后儿童会出现耳朵疼痛，甚至引起耳道中有脓性分泌物的存在，如果不给儿童及时的进行处理，会引起听力的损伤以及造成鼓膜的穿孔。所以儿童在发生发烧后耳朵疼的情况，要及时的到儿童医院的口腔科或者耳鼻喉科进行就诊，如果有急性中耳炎，需要及时的应用抗菌药物。