红眼病大部分不能自愈，只有少部分病毒感染所导致的红眼病个别有自愈倾向，一般一个星期左右会慢慢自愈。
红眼病需要通过药物治疗来缩短病程，谨防疾病的加重。不同病因导致的红眼病治疗方法不一样，红眼病治疗的时间根据不同的病原体、病情的轻重因人而异。细菌导致的红眼病一般潜伏期为1-3天，病程多少于三周，通过积极的抗感染治疗，例如局部使用广谱的抗生素眼药水、眼膏予以辅助治疗，可以减轻患者的眼部症状，适当的缩短病程，经过有效的治疗，大部分患者一般在两周内可以治愈。