确诊新型冠状病毒肺炎，病原学或血清学的证据是必不可少的，确定病原学的检测方法有新型冠状病毒的核酸检测，还有就是病毒的基因测序。另外血清学的证据是指血清新型冠状病毒特异性抗体的测定，在临床上一般通过检测两次和新型冠状病毒的核酸。在检测新型冠状病毒核酸阳性后，一般还会再复核一次检测。 如果再次检测还是阳性的话，就考虑是新型冠状病毒感染。
此外还要结合患者是否具有临床表现来判断是不是新型冠状病毒肺炎或者无症状感染者。由于目前血清学证据也作为了确诊新型冠状病毒肺炎的证据之一，所以在检测新型冠状病毒核酸阳性后，也可以再测定血清学，也就是进行新型冠状病毒特异性抗体的检测，进而来确认新型冠状病毒感染的诊断。