抑制病毒辅助的药很多，目前常用的药包括治疗乙型肝炎的药，如拉米夫定、阿德福韦酯、替比夫定、恩替卡韦、替诺福韦。治疗丙型肝炎的药，有索非布韦、维帕他韦、达卡他韦。抑制艾滋病毒复制的药，如恩曲他滨、齐多夫定、依法韦仑、奈韦拉平、替诺福韦等。
这些药物共同的特点是抑制病毒复制，但是不能完全清除病毒，而且有些药物会有一些毒副作用，以及长期应用会出现耐药的发生。拉米夫定在治疗乙型肝炎过程当中，出现耐药率很高。替诺福韦可以治疗乙型肝炎和艾滋病，但是在治疗过程当中，有时会出现肾毒性反应。