宝宝发热39℃时，出现手脚冰凉时，处理办法可以应用药物、物理退热，具体处理方法如下：
1、应用药物：首先要明确宝宝发热39℃，手脚冰凉是常见的一种表现，主要是因为在高热状态之下，儿童会出现手脚凉等末梢循环不好的表现。处理办法主要是根据温度情况，需要立即应用退热药物进行治疗。可以选择要对乙酰氨基酚或者布洛芬成分的退热药物进行口服，或者采取相应的退热药物的栓剂来进行治疗，选择一种。
2、物理退热：由于宝宝温度持续高热，手脚凉等情况时需要立即配合物理降温，才可以使宝宝的温度退至正常。对于物理降温的方式，可以让宝宝适当的多喝温热水，勤喝温热水，有利于温度退至正常。如果采用温热水进行擦拭时，仅针对颈部、腋下、腹股沟等血管丰富的部位进行擦拭即可，前提是宝宝并没有明显寒战的情况，如果宝宝有寒战的表现时，则不建议用水去进行擦拭，否则会导致宝宝特别不舒服。高热状态之下，这种手脚凉的时候，也可以不进行洗澡等方式来进行退热，可以给宝宝适当的采取用热水泡脚的方式，也可以缓解宝宝手脚凉的现象，也可以促进和恢复血液循环，更有利于温度退至正常。