胃镜是一种有创的检查，任何有创的检查都会有风险;
1、比方说上消化道黏膜的擦伤，如咽喉部的擦伤，患者做完胃镜后数天内都有可能感觉到咽部的疼痛不适。
2、取活检之后的出血，对病变部位取活检有可能造成活检之后上消化道出血，病人表现为黑便，甚至呕血。
3、因为做胃镜有一定的痛苦性，会造成患者的心率增快、血压升高。
4、若患者存在一定的基础疾病，如脑血管病以及心血管疾病，心率血压的波动可能会诱发出现急性的心脑血管事件，如急性心肌梗死以及急性脑梗死等等。