肺部真菌感染会出现很多种情况，如下：
第一、有的时候可能是隐匿性感染，并不会出现相应的症状和体征，可以自愈。
第二、有的会出现类似于细菌感染，如细菌性肺炎的症状，实际上是真菌感染所引起的肺炎，可以出现发热、咳嗽、咯白色黏液痰或浓痰、咯血，还有胸闷、气喘等呼吸道症状，肺部听诊可以听到干湿性啰音，有可能伴有胸腔积液。
第三、肺部真菌感染有可能会出现脓肿、脓胸，这时候一般可能会伴有寒颤、高热、咳嗽、咯脓性痰，有时候痰中伴有臭味，咯血都是痰中带血。有的时候可能表现出类似于肿瘤样的表现，比如隐球菌瘤、组织胞浆菌瘤、球孢子菌瘤等，需要与肺癌相鉴别。
第四、因为真菌感染也可以引起肺栓塞，这种都见于嗜血管性毛霉菌，容易侵犯血管而导致肺栓塞甚至梗塞，其它也可以引起弥漫性间质性改变。