结肠黑变病一方面是见于长期服用中药的患者，因为中药的颜色长期浸润结肠，可能导致色素进入到结肠黏膜上皮的细胞内，导致结肠的颜色发黑。
更常见的原因是长期服用蒽醌类刺激性的泻药，如番泻叶、果导片、麻仁润肠丸等，这一类刺激性的泻药除了能够导致结肠黑变病以外，还会影响到肠道肌肉之内的神经元细胞，导致肌肉的蠕动更加缓慢，会加重便秘，从而造成对导泻药的依赖，不用药患者的便秘会加重。并且结肠黑变病，其结肠癌的发病风险有一定程度的提高，在停用这一类的泻药以后，结肠黑变病的情况会有所改善。