感冒发烧引起全身疼的原因，主要有两个方面：
1、病毒或细菌入侵体内，释放相应的毒素，和引起炎症反应产生相应的炎症介质，比如肿瘤坏死因子、白细胞介素6、白三烯、前列腺环素等物质，这些炎症介质刺激相应部位的神经末梢，从而产生疼痛，并且引起相应的发热症状。
2、感冒发烧时，尤其是高热时，使体内的代谢加快，造成相对的缺氧状态，从而体内的生化反应不能够正常进行，能量代谢障碍，无氧酵解加强，从而生成较多的乳酸，引起乳酸堆积，导致全身肌肉酸痛症状。
因此，感冒高热时要及时给予有效的退热治疗，比如使用非甾体类解热、镇痛药物，缓解发热和全身痛的症状。